Namibya ve Botswana’da bulunan milattan önce 3000 yılına ait kalıntılar, o dönemin karpuzlarının bugünkülerden çok farklı olduğunu gösteriyor. 5 santimetre çapında ve 18 çekirdekli bu küçük karpuzun kabuğunu kırmak için çekiç veya keskin bir obje gerekiyordu. İçeriğinin yüzde 80’i su olan bu meyvenin, yüzde 1,9’u şeker ve yüzde 18,1’i nişasta ve yağ gibi maddelerden oluşuyordu. Ayrıca, bu karpuzların 6 farklı türü vardı ve yenildiğinde vücutta iltihaba neden oluyordu.